Технология NanoString

Технология Nanostring позволяет проводить прямое мультиплексное измерение транскрипционной активности генов и уровня трансляции соответствующих им белков, профилирование экспрессии микроРНК и оценку копийности генов (в том числе в одной клетке).  В основу метода положено мечение мишеней уникальными цветовыми штрих-кодами, прикрепленными к мишень-специфичным зондам и их последующая детекция. За счет исключения из технологического процесса этапа амплификации и, как следствие, связанных с ним ошибок, демонстрируется высокий уровень точности и чувствительности.

Основные преимущества метода:

 

  • Единовременное измерение экспрессии сотен генов-мишеней/микроРНК и десятков белков в одной реакции
  • Высокая чувствительность (<1 копии на клетку)
  • Полностью автоматизированная система
  • Отсутствие этапов энзиматической обработки образцов
  • Малые объемы исходного материала
  • 10 контрольных образцов, включенных в каждый набор

 

 

Каждый цветовой штрих-код представляет собой одну мишень для последующей детекции. Штрих-коды гибридизуются напрямую с мишенями и, таким образом, учитываются в индивидуальном порядке, что позволяет исключить этап амплификации.

  1. Гибридизация.  К мишени прикрепляется сигнальная проба (Reporter Probe) и захватывающая проба (Capture Probe). Благодаря первому возможна детекция мишени, последнему – иммобилизация комплекса.
  2. Очистка и иммобилизация. После гибридизации излишки реактивов удаляются, а комплекс проба-мишень иммобилизуется на специальном картридже
  3. Детекция. Картриджи помещаются в цифровой анализатор для детекции сигнала и получения первичных данных.